Аллергия на амоксициллин встречается довольно часто и проявляется в виде таких заболеваний как крапивница, атопический дерматит, отек Квинке, аллергический ринит, аллергический конъюнктивит. При системном введении данного препарата возможен и анафилактический шок. Очень часто при сенсибилизации к пенициллину наблюдаются перекрестные аллергические реакции к полусинтетическим пенициллинам, цефалоспоринам, монобактамам, карбапенемам. Одним из основных факторов гуморального звена иммунитета является иммуноглобулин Е (IgE), вырабатываемый главным образом в подслизистом слое различных тканей в ответ на действие аллергенов. Анализ крови на определение IgЕ к амоксициллину может быть использовано для выявления сенсибилизации.